是确定药物的名称和别名；集解是叙述药物的产地和形态；正误是纠正前人对药物的错误认识；修治是介绍药物的炮制方法和注意事项；气味是分析药物的性质和归经；主治是说明药物的功效和适用范围；发明是记录作者对药物的亲身体验或新发现；附方是收集使用该药物的方剂和验方每一项都有详细的注释和引证，既有理论依据，又有实践证据
    《本草纲目》还附有1109幅精美的插图，对于一些形态复杂或难以描述的药物，如动物、植物的各个部位，都用图示来辅助说明，使读者更容易理解和辨识这些插图大多由李时珍的儿子李建元和李建木所绘，虽然不是专业画家，但也尽力做到形神兼备，真实可信
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